胆胰管被肝脏、胃及十二指肠包绕而检查困难，无论是胆胰炎症性病变还是肿瘤性病变相对消化系统疾病诊治都较困难，超声内镜（EUS）及逆行胰胆管造影术（ERCP）等内镜技术的发展，可发现部分影像学检查无法发现或诊断的疾病，提高疾病检出率和诊断率。本中心具有专业的EUS及ERCP团队，胆胰疾病诊断率高，内镜下治疗规范，现已常规开展包括超声内镜检查、超声内镜下穿刺、ERCP取石术、胰胆管支架置入术等胆胰疾病内镜技术，能为患者提供更个体化的微创诊疗。
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