胃肠外科常规开展各类胃肠道良恶性肿瘤、消化道危急重症等疾病的微创手术治疗，包括腹腔镜下胃癌根治术、腹腔镜下左/右半结肠癌根治术、腹腔镜下直肠癌根治术（拖出式/降落伞式吻合、低位保肛）、腹腔镜下胃肠间质瘤切除术、盆底/肛周疑难杂症的微创手术治疗、消化道梗阻/穿孔等危急重症的综合诊治等，使用微创技术联合快速康复理念治疗消化道良恶性肿瘤，为浙中地区唯一胃肠道间质瘤定点处方医院。胃肠外科建设有多个疾病诊治中心（胃癌诊治中心、肠癌诊治中心、盆底疑难疾病诊治中心、胃肠间质瘤诊治中心），并建设有胃癌MDT团队及大肠癌MDT团队，常规开展重大疑难疾病的多学科诊治，在晚期消化道肿瘤的综合治疗（化疗/免疫治疗/靶向治疗）等方面具有丰富的诊治经验，并且通过精准化的新辅助/转化治疗，提高肿瘤根治率，从而改善预后。同时开展各类腹股沟疝、腹壁疝、小儿疝等微创手术外科治疗。包括TEP,TAPP,Lichtenstein,Shouldice等术式，以及腹腔镜下白线疝，腰疝，三角疝，切口疝，造口旁疝等修补术。